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癌症药物发现的强大工具:PDX和PDO配对样本库

2023-08-23 14:30:38   来源:
背景
癌症是一种严重威胁人类健康的疾病,需要不断地开发新的有效治疗方法。为了提高癌症药物发现的效率和准确性,需要建立能够模拟患者肿瘤特征的实验模型。目前,最具预测性的转化肿瘤学模型是由癌症干细胞(CSC)驱动的患者来源的异种移植物(PDX)和类器官(PDO)。PDX和PDO之间有很高的相似性和一致性,可以互为替代或互补。
 
冠科生物的李其翔博士团队利用已有的PDX库,通过体外培养和冻存技术,建立了一个包含超过550对不同癌症类型的PDX和PDXO(PDX来源的类器官)匹配对的生物库,并通过基因组、组织学和药理学分析验证了它们之间的相似性和一致性(图1-3)。

图1. 建立PDXO生物库并确定其特征。a从西方和亚洲患者来源的PDX库中建立PDXO的工作流程示意图,并对入库模型进行特征分析。b三个选定的PDXO模型(胰腺肿瘤、肺部肿瘤和黑色素瘤)的明视野(上图)和H&E染色(组织病理学,中图),显示囊性、紧密和葡萄状表型,以及匹配的PDXH&E染色(下图);c来自9种不同癌症类型(结肠癌、肺癌、胃癌、胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌、胆管癌、肝脏和膀胱)的59个匹配PDX/PDXO数据集的WES分析;d来自11种癌症类型(结肠癌、肺癌、胃癌、胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌、胆管癌、肝脏、膀胱、食管和黑色素瘤)83个匹配PDX/PDXO数据集的RNAseq表达分析,显示中值。

图2. PDXO 384孔板测定法具有高度的可靠性、稳健性,适合HTS。a)由溶媒/阳性对照的发光比率定义的129个PDXO品系的信噪比;b)384孔格式的138个PDXO模型的板内分析的Z-prime;c)板间分析。d)不同癌症类型的多个模型的SOC反应;e)胰腺PDXO(PA2847、PA5389和PA1252)对吉西他滨(♦)、MK1775(▲)和MK8776(●)的剂量反应;f)在PA2847 PDXO模型中,通过Bliss数学模型对吉西他滨+MK1775(左)或吉西他滨+MK1775 MK8776(右)的协同作用评分的三维反应面图。

图3. 体外PDXO和体内PDX药理学之间的高度相关性。a)NSCLC LU1235(EGFR激活19号外显子缺失)PDXO对厄洛替尼和AZD9291的剂量反应,以确定绝对IC50值和最大抑制作用;b)在30个PDXO/PDX配对的数据集(左侧)中,匹配PDXO体外和PDX体内反应,以确定PDXO对PDX反应的预测能力。体外和体内敏感/反应或抗性/无反应的标准显示在右图上。c)厄洛替尼在NSCLC LU2512(EGFR野生型)PDX体内的生长和治疗反应,PDXO体外和PDXO异种移植体内。d)三个模型(从上到下;肺癌LU2512、肝癌LI0612和胃癌GA0019)的H&E染色,作为PDX、PDXO或PDXO生长。


作者还展示了这个生物库在癌症药物发现中的多种应用,包括:利用PDXO进行高通量筛选(HTS),寻找最有效的候选药物或适应症(图2);利用工程化技术,使PDXO和PDX具有体内外成像能力,方便观察肿瘤生长和转移(图4);利用PDXO进行机制解析,探索药物作用靶点和信号通路;利用PDXO与免疫细胞共培养,评价免疫治疗的效果(图5)。

图4. 类器官工程使荧光素酶标记的PDXO可以进行实时跟踪。a)LI6664-luc PDXO的体内皮下成像;b)皮下LI6664-luc PDXO异种移植形态和对克唑替尼的治疗反应。c) 植入肝脏的正位LI6664-luc PDXO的实时光学成像,以确定肝脏中的生长动力学,每天成像的代表小鼠图像。


图5. PDXO与免疫细胞的共培养。a)通过与PBMCs和Herceptin™共培养确定ADCC介导的对HER2+卵巢肿瘤类器官OV0250的杀伤力,并通过流式细胞仪进行量化;b)与免疫细胞或作用机制和不同类型的终点读出的共培养系统示意图;c)CAR-T细胞介导的对肝癌类器官的特异性杀伤,该类器官被设计为同时表达人类CD19和荧光素酶或仅表达荧光素酶,与CD19 CAR-T细胞以1:10的比例培养2天,用荧光素酶的活性来跟踪类器官的生长/杀伤。代表性的明视野图像显示了LI6677-CD19-luc PDXO或LI6677-luc PDXO在不同时间点的共培养的形态变化。d)EpCAM+胃癌类器官与EpCAM-CAR-T细胞共培养,与EpCAM-黑色素瘤类器官相比,通过d)IFNγ和e)颗粒酶B ELISA在24和48小时内测量,导致CAR-T细胞活化/介导的杀伤。

作者还展示了这个生物库在癌症药物发现中的多种应用,包括:利用PDXO进行高通量筛选(HTS),寻找最有效的候选药物或适应症(图2);利用工程化技术,使PDXO和PDX具有体内外成像能力,方便观察肿瘤生长和转移(图4);利用PDXO进行机制解析,探索药物作用靶点和信号通路;利用PDXO与免疫细胞共培养,评价免疫治疗的效果(图5)。


文章来源:
https:/pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36822598/

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